№1

Вывести список глобально установленных пакетов

$ npm -g ls --depth=0

/home/bubujka/.nvm/versions/node/v4.1.1/lib
├── async@1.4.2
├── bower@1.6.5
├── browserify@12.0.1
├── bu-tgl@0.0.0 -> /home/bubujka/.bu.tgl
├── csvtojson@0.4.3
├── ember-cli@1.13.13
├── enml2md@0.1.0 -> /home/bubujka/.db/prj/enml2md
...
№2

Заставляем npm добавлять в зависимости пакеты, даже если ставим их без ключа --save 

$ npm config set save=true
№3

npm будет созранять точную версию пакета в зависимости

$ npm config set save-exact=true