С помощью npm-check-updates можно узнать какие зависимости обновились с момента их установки с помощью npm/bower.

Устанавливаем:

$ npm i -g npm-check-updates

И проверяем что в package.json устарело:

$ ncu

# async          ^1.4.2  →  ^2.0.0-rc.2
# cheerio       ^0.19.0  →      ^0.20.0
# front-matter   ^1.0.0  →       ^2.0.6
# glob          ^5.0.14  →       ^7.0.3
# html-to-text   ^1.5.0  →       ^2.1.0
# inquirer       ^0.9.0  →      ^0.12.0
#
# Run with -u to upgrade package.json

Проверяем что есть нового для bower.json:

$ ncu -m bower
# angular  ~1.4.9  →  ~1.5.3
#
# Run with -u to upgrade bower.json

Обновить версии пакетов в package.json/bower.json можно ключом -u:

$ ncu -u
$ ncu -m bower -u